Ilgalaikės institucinės MTEP programos – ilgalaikiai MTEP darbai, kuriuos vykdo valstybiniai mokslinių tyrimų institutai.
Institucijos gali siūlyti, kad būtų vykdomi joms reikalingų arba aktualių tematikų MTEP darbai.
- Programos trukmė – iki 5 metų
- Finansavimas: valstybės biudžeto asignavimai
- Priemonę vykdo mokslinių tyrimų institutai